С момента создания кафедры научно-исследовательская работа велась по следующим направлениям:
• теория колец и модулей над ними (1962);
• поверхности в евклидовых, псевдоевклидовых и полуевклидовых пространствах (1980);
• алгебраические системы и связанные с ними структуры (1976);
• новые информационные технологии в образовании (1985).
Кафедра поддерживает связи с крупными научными центрами:
• Московским государственным университетом им. М.В.Ломоносова;
• Московским госпедуниверситетом им. В.И.Ленина;
• Российским государственным педуниверситетом им. А.И.Герцена;
• Новосибирским государственным университетом;
• Институтом Математики Сибирского отделения АН РФ;
• Томским государственным университетом,
• Саратовским государственным университетом и др.
С 1996 года при кафедре открыта магистратура по направлению “Математическое образование”. Большинство из окончивших магистратуру либо продолжает учебу в аспирантуре, либо работает в колледжах, вузах и др. учебных заведениях города.
В 1997 году на кафедре была открыта аспирантура по специальности 01.01.06 «Математическая логика, алгебра и теория чисел». За это время четыре преподавателя кафедры защитили кандидатские диссертации по этой специальности: А.П. Бощенко (1998 г), А.В. Карташова (2001), П.Б. Жданович (2004), В.Л.Усольцев (2009 г.). В университете в сотрудничестве с МГУ им. М.В. Ломоносова при активном участии кафедры были проведены:
• Международный семинар «Универсальная алгебра и ее приложения», посвященный памяти профессора МГУ Л.А. Скорнякова (сентябрь 1999 г);
• Региональный семинар «Алгебра, теория чисел и ее приложения» и «2-я школа молодых алгебраистов» (август 2003 г);
• Второй международный семинар «Универсальная алгебра и теория чисел и их приложения» и «3-я школа молодых алгебраистов» (сентябрь 2005 г);
• Третий международный семинар «Универсальная алгебра и теория чисел и их приложения» и «4-я школа молодых алгебраистов» (сентябрь 2007 г).
• Четвертый международный семинар «Универсальная алгебра и теория чисел и их приложения» и «5-я школа молодых алгебраистов» (сентябрь 2009 г).
• Х-ая Международная конференция «Алгебра и теория чисел: современные проблемы и приложения» (сентябрь 2012 г).
На кафедре постоянно работает семинар «Алгебраические системы и связанные с ними структуры», на котором выступают с научными сообщениями преподаватели, аспиранты, магистранты и студенты.