В соответствии с приказом № 01-01-16 от 01.02.2017 г. утверждена структура научных подразделений университета
Общеуниверситетские подразделения
1. Волгоградский научно-образовательный центр РАО, рук. - Сергеев Н.К.
2. Научная лаборатория информационных технологий образования им. А.В. Петрова, рук. - Земляков Д.В.
3. Научно-образовательный центр прикладных исследований интернет-образования, рук. - Сергеев А.Н.
В составе факультета естественно-научного образования, физической культуры и безопасности жизнедеятельности
4. Научно-учебная лаборатория "Ботанический сад", рук. - Сурагина С.А.
5. Научно-образовательный экологический центр, рук. - Алферова Г.А.
В составе факультета исторического и правового образования
6. Научно-образовательный исторический центр
7. Научно-исследовательская археологическая лаборатория им. В.И. Мамонтова
В составе факультета математики, информатики и физики
8. Научно-учебная лаборатория физики низкоразмерных систем, рук. - Крючков С.В.
Научные школы
1. Разработка теоретико-методологических основ целостного педагогического процесса в школе и вузе, рук. Сергеев Н.К.
2. Межкультурная коммуникация, рук. Леонтович О.А.
3. Электронные свойства низкоразмерный структур в условиях воздействия сильных внешних полей, рук. Крючков С.В.
4. Региональная лингвистика, рук. Супрун В.И.
5. Методические системы обучения математике, информатике, физике, рук. Коротков А.М.
В ВГСПУ также функционируют общественные научные объединения (НОЦ, НИЛ, НИЦ):
Педагогические и психологические науки − 16 объединений, филологические науки − 13 объединений, исторические науки − 4 объединения, математика и естественные науки − 5 объединений, искусство и искусствоведение − 2 объединения.